ტრანსასაზღვრო მდინარე მტკვრის პროექტი მისი აუზისა და ეკოსისტემის დაცვას და აღდგენას ისახავს მიზნად. პროექტის მხარდამჭერები არიან საქართველოსა და აზერბაიჯანის მთავრობები, გაეროს განვითარების პროგრამა და გლობალური გარემოსდაცვითი ფონდი.